واحد عملیات مسئولیت هماهنگی کلیه فرآیندهای پشت پرده‌ی وب‌سایت و اپلیکیشن دیجی‌کالا را برعهده ‌دارد. این واحد از چهار گروه اصلی تشکیل شده که هرکدام با انجام فعالیت‌های متفاوت اما مربوط به هم در تلاش هستند تا تجربه‌ای خوب از خرید آنلاین را برای مشتری‌ها رقم بزنند.